Huella peptídica

La huella peptídica o PMF (del inglés Peptide mass fingerprinting), es una técnica analítica de identificación de proteínas desarrollada en 1993 por varios equipos de investigación de forma independiente.[7]

Para el uso de la técnica de la huella peptídica debe disponerse de la proteína pura, o, de existir mezclas de dos o tres, debe acoplarse un MS/MS adicional. Como paso preparativo, el aislamiento de la proteína de interés suele realizarse mediante electroforesis en gel bidimensional o mediante electroforesis SDS-PAGE. Los análisis adicionales mediante MS/MS pueden ser directos, generalmente mediante MALDI-TOF/TOF o nanoLC-ESI-MS/MS análisis de los elementos recortados del gel de electroforesis bidimensional.[9]

  • referencias

Referencias

  1. Pappin DJ, Hojrup P, Bleasby AJ (1993). «Rapid identification of proteins by peptide-mass fingerprinting». Curr. Biol. 3 (6): 327-32. 15335725. 10.1016/0960-9822(93)90195-T. 
  2. Henzel WJ, Billeci TM, Stults JT, Wong SC, Grimley C, Watanabe C (1993). «Identifying proteins from two-dimensional gels by molecular mass searching of peptide fragments in protein sequence databases». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90 (11): 5011-5. 8506346. 10.1073/pnas.90.11.5011. 
  3. Mann M, Højrup P, Roepstorff P (1993). «Use of mass spectrometric molecular weight information to identify proteins in sequence databases». Biol. Mass Spectrom. 22 (6): 338-45. 8329463. 10.1002/bms.1200220605. 
  4. James P, Quadroni M, Carafoli E, Gonnet G (1993). «Protein identification by mass profile fingerprinting». Biochem. Biophys. Res. Commun. 195 (1): 58-64. 8363627. 10.1006/bbrc.1993.2009. 
  5. Yates JR, Speicher S, Griffin PR, Hunkapiller T (1993). «Peptide mass maps: a highly informative approach to protein identification». Anal. Biochem. 214 (2): 397-408. 8109726. 10.1006/abio.1993.1514. 
  6. Clauser KR, Baker P, Burlingame AL (1999). «Role of accurate mass measurement (+/- 10 ppm) in protein identification strategies employing MS or MS/MS and database searching». Anal. Chem. 71 (14): 2871-82. 10424174. 10.1021/ac9810516. 
  7. a b Shevchenko A, Jensen ON, Podtelejnikov AV, Sagliocco F, Wilm M, Vorm O, Mortensen P, Shevchenko A, Boucherie H, Mann M (1996). «Linking genome and proteome by mass spectrometry: large-scale identification of yeast proteins from two dimensional gels». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93 (25): 14440-5. 8962070. 10.1073/pnas.93.25.14440. 
  8. Wang W, Sun J, Nimtz M, Deckwer WD, Zeng AP (2003). «Protein identification from two-dimensional gel electrophoresis analysis of Klebsiella pneumoniae by combined use of mass spectrometry data and raw genome sequences». Proteome Science 1 (1): 6. 14653859. 10.1186/1477-5956-1-6. 
  9. Hufnagel P, Rabus R (2006). «Mass spectrometric identification of proteins in complex post-genomic projects. Soluble proteins of the metabolically versatile, denitrifying 'Aromatoleum' sp. strain EbN1». J. Mol. Microbiol. Biotechnol. 11 (1-2): 53-81. 16825790. 10.1159/000092819.